Question

Difficulty: Very hardGram Negatif Koklar ve Kokobasiller

*Neisseria gonorrhoeae* enfeksiyonları sırasında, bakterinin konak hücrelerine sıkı yapışmasını ve fagositozdan kaçınmasını sağlayan Opa (opacity) proteinlerinin ekspresyonu dinamik olarak değişebilmektedir (faz varyasyonu). Bu proteinlerin ekspresyon düzeyindeki değişimlerin temelinde yatan ve translasyonel çerçeve kaymasına (frameshift) neden olan moleküler mekanizma aşağıdakilerden hangisidir?

  1. A
    Pilin lokuslarındaki (pilSpilS ve pilEpilE) sessiz genlerin rekombinasyonu ile oluşan gen konversiyonu
  2. Sinyal peptid kodlayan bölgedeki pentanükleotid (CTCTTCTCTT) tekrarlarında eşleşme hatası (slipped-strand mispairing)Answer
  3. C
    Promotör bölgesindeki DNA dizisinin ters dönmesi (inversiyon) yoluyla genin yön değiştirmesi
  4. D
    Dış membran veziküllerinin (blebbingblebbing) ortama salınması ile yüzey proteinlerinin yoğunluğunun azalması
  5. E
    LOSLOS (lipooligosakkarit) yan zincirlerine konak kaynaklı sialik asit eklenmesi

Answer

Opa proteinlerinin faz varyasyonu, sinyal peptid bölgesindeki CTCTTCTCTT tekrarlarında gerçekleşen eşleşme hatası (slipped-strand mispairing) sonucu oluşan çerçeve kayması ile gerçekleşir.
Doğru yanıt olan seçenek, Opa proteinlerinin ekspresyonunun sinyal peptid bölgesindeki CTCTTCTCTT tekrarlarının sayısındaki değişimle (slipped-strand mispairing) kontrol edildiğini belirtmektedir. 5 bazlı bu tekrarların sayısındaki değişim, genin okuma çerçevesini değiştirerek (frameshift) proteinin sentezlenip sentezlenmeyeceğini belirler.

Step-by-Step Solution

1
Neisseria türlerinde Opa proteinlerinin genetik yapısını analiz et.
Opa genlerinin 5' ucunda, sinyal peptidi kodlayan bölgede çok sayıda CTCTTCTCTT (pentanükleotid) tekrarı olduğu görülür.
Bu tekrarlar, DNA replikasyonu sırasında hata oluşmasına yatkın bölgelerdir.
2
Replikasyon sırasında gerçekleşen 'slipped-strand mispairing' mekanizmasını değerlendir.
DNA polimeraz bu bölgeden geçerken ipliklerde kayma olması durumunda CTCTTCTCTT tekrar sayısı artar veya azalır.
Tekrar sayısındaki değişim, 5 rakamı 3'ün katı olmadığı için okuma çerçevesini (reading frame) değiştirir.
3
Çerçeve kaymasının (frameshift) translasyon üzerindeki etkisini incele.
Eğer tekrar sayısı genin 'açık' (in-frame) kalmasını sağlarsa fonksiyonel Opa proteini sentezlenir; aksi halde protein sentezi durur.
Bu translasyonel kontrol, bakterinin yüzey proteinlerini ortama göre hızla değiştirmesini (faz varyasyonu) sağlar.

Key Concept

Neisseria Opa proteinlerinde faz varyasyonu, sinyal peptid bölgesindeki pentanükleotid tekrarlarının sayısı ile kontrol edilen bir translasyonel çerçeve kayması mekanizmasıdır.
Estimated Time:1m 30s
Rate this question