Question

Difficulty: HardLizozomlar ve Endozomlar

Hücre biyolojisinde lizozomal biyogenez süreci incelendiğinde; lizozomal membran proteinlerinin (örneğin LAMPLAMP ve LIMPLIMP aileleri) trans-Golgi ağından (TGNTGN) veya plazma membranından endozomal/lizozomal sisteme doğru gerçekleşen veziküler trafiği ve hedeflenmesi ile ilgili aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

  1. Bu proteinler, sitoplazmik kuyruklarında yer alan tirozin bazlı (YXXΦYXX\Phi) veya di-lösin bazlı motifler aracılığıyla adaptör protein (APAP) kompleksleri tarafından tanınarak veziküllere paketlenirler.Answer
  2. B
    Tüm lizozomal membran proteinleri, çözünür asit hidrolazlar gibi mannoz-6-fosfat (M6PM6P) reseptörlerine bağlanarak trans-Golgi ağından ayrılırlar.
  3. C
    Bu proteinlerin lizozomal membrana doğru taşınması sürecinde, peroksizomal hedefleme sinyali 1 (PTS1PTS1) ve buna bağlanan Pex5Pex5 reseptörü anahtar rol oynar.
  4. D
    Lizozomal membran proteinlerinin lümen taraflarındaki oligosakkarit zincirlerine NN-asetilglukozaminil-1-fosfotransferaz tarafından M6PM6P eklenmesi hedeflenme için zorunludur.
  5. E
    Bu proteinler, sitoplazmik kısımlarında bulunan KDELKDEL (Lizin-Aspartat-Glutamat-Lösin) dizisi sayesinde granüllü endoplazmik retikulumdan (GERGER) direkt olarak geç endozomlara tomurcuklanırlar.

Answer

Lizozomal membran proteinleri, sitoplazmik kuyruklarındaki tirozin bazlı veya di-lösin bazlı motiflerin adaptör protein kompleksleri tarafından tanınması yoluyla hedeflenirler.
Doğru seçenek, lizozomal membran proteinlerinin biyogenezindeki temel kuralı ifade etmektedir. LAMPLAMP ve LIMPLIMP proteinleri, sitoplazmik uzantılarında bulunan tirozin bazlı (YXXΦYXX\Phi - buradaki Φ\Phi hidrofobik bir aminoasittir) veya di-lösin bazlı diziler sayesinde APAP kompleksleri (özellikle AP1AP-1 ve AP3AP-3) tarafından tanınır ve klatrin kaplı veziküllere alınarak endozomal sisteme yönlendirilir.

Step-by-Step Solution

1
Lizozomal protein tiplerini ayırt etme
Lizozom proteinleri 'çözünür lümen enzimleri' ve 'membran proteinleri' olarak ikiye ayrılır.
Bu iki grup proteinin TGN'den çıkış ve lizozoma varış mekanizmaları birbirinden farklıdır.
2
Membran proteinlerinin hedefleme sinyallerini belirleme
LAMP-1, LAMP-2, LIMP-2 gibi proteinlerin sitoplazmik kuyruklarında kısa aminoasit dizileri (tirozin bazlı YXXΦYXX\Phi veya di-lösin motifleri) bulunur.
Bu motifler, klatrin kaplı vezikül oluşumunu sağlayan adaptör proteinlerin (AP-1, AP-2, AP-3) bağlanma yerleridir.
3
Taşıma yolağını analiz etme
Bu proteinler ya direkt yolla (TGN → endozom) ya da indirekt yolla (TGN → plazma membranı → endozom) lizozoma ulaşırlar.
Her iki yolda da klatrin ve AP kompleksleri bu spesifik sitoplazmik motifleri tanıyarak seçici paketleme yapar.

Key Concept

Lizozomal membran proteinleri (LAMP/LIMP), çözünür enzimlerin aksine mannoz-6-fosfat bağımsız olarak, sitoplazmik kuyruk motifleri (YXXΦYXX\Phi veya di-lösin) ve adaptör proteinler (APAP) aracılığıyla hedeflenirler.

Practice More

I-cell hastalığında (mukolipidoz II) lizozomların membran yapısının neden korunduğunu ancak lümen içeriğinin neden boş olduğunu bu protein hedefleme farkı üzerinden tekrar ediniz.
Estimated Time:1m 30s
Rate this question