Question

Bakterilerde çoklu ilaç direncinin (MDR) yayılmasında kritik öneme sahip olan Sınıf 1 integronlar; bir integraz geni (intI1intI1), bir birincil rekombinasyon bölgesi (attIattI) ve direnç kasetlerinin ekspresyonunu sağlayan bir ortak promotörden (PcPc) oluşur. İntegrona giren gen kasetleri genellikle promotörsüz (açık okuma çerçevesi - ORF şeklinde) olduğu için, bu kasetlerin ekspresyonu bütünüyle PcPc promotörüne bağımlıdır. Sınıf 1 integronlarda yer alan bu ortak promotör (PcPc), genetik organizasyon açısından aşağıdaki bölgelerin hangisinde konumlanmıştır?

  1. İntegraz geninin (intI1intI1) 5' uç kodlayıcı dizisi içerisindeAnswer
  2. B
    Gen kasetlerinin bütünleştiği "attI" rekombinasyon bölgesi üzerinde
  3. C
    Kasetleri birbirinden ayıran "attC" (59-be) dizileri içerisinde
  4. D
    3' korunmuş segmentte (3CS3'-CS) yer alan sülfonamid direnç geni (sul1sul1) içinde
  5. E
    Plazmidin otonom replikasyonundan sorumlu "oriV" bölgesi yakınında

Answer

Sınıf 1 integronlarda gen kasetlerinin ekspresyonundan sorumlu olan Pc promotörü, integraz geninin (intI1) 5' uç kodlayıcı dizisi içerisinde yer alır.
Sınıf 1 integronlarda gen kasetleri, integronun 5' korunmuş segmentinde (5'-CS) bulunan ortak bir promotör (Pc) tarafından kontrol edilir. Bu Pc promotörü, fiziksel olarak integraz geninin (intI1intI1) başlangıç kısmındaki kodlayıcı dizi içerisinde yer alır ve transkripsiyon yönü attI bölgesine ve oradan da kasetlere doğrudur.

Step-by-Step Solution

1
Sınıf 1 integronun temel bileşenlerini analiz et.
İntegraz geni (intI1), rekombinasyon bölgesi (attI) ve 3' korunmuş segment (3'-CS) tanımlandı.
Genetik elementin organizasyonunu anlamak çözüm için ilk adımdır.
2
Direnç kasetlerinin yapısal özelliğini belirle.
Kasetlerin çoğunlukla promotörsüz olduğu ve tek başlarına ifade edilemedikleri saptandı.
Bu durum, kasetlerin ifadesi için integronun kendi üzerinde bir promotör taşıması gerektiğini açıklar.
3
Pc (promoter for cassettes) promotörünün yerini saptan.
Pc promotörünün intI1 geninin içinde olduğu, ancak integrazın tersi yönünde (kasetlere doğru) transkripsiyon başlattığı belirlendi.
Bu spesifik yerleşim, integrona yeni giren kasetlerin hemen ifade edilmesini sağlar.

Key Concept

İntegronlar, gen kasetlerini yakalayan ve ifade eden mobil genetik elementlerdir; Sınıf 1 integronlarda Pc promotörü intI1 geni içinde yer alır.